.NETで互換性の問題は起こらないとはいうが・・・
特定のPCで.NetFrameworkのノータッチデプロイメントで動作するシステムが動かなくなりました。
ちょっと調べてみると
Visual Studio User Group > フォーラム >
VS2003とVS2005の競合
http://vsug.jp/tabid/63/forumid/43/postid/911/view/topic/Default.aspx
ノータッチデプロイメントでうまく配布できない(.NetFx1.1+.NetFx2.0+IE7の環境) - MSDN
フォーラム
http://forums.microsoft.com/MSDN-JA/ShowPost.aspx?PostID=1586920&SiteID=7
Re: .NET2.0と.NET1.1が混在するクライアント環境でのノータッチデプロイメントの挙動について - MSDN
フォーラム
http://forums.microsoft.com/msdn-ja/ShowPost.aspx?PostID=809861&SiteID=7
と、いろいろと報告されています。結構大きな問題なのですが解決方法が見つからず。
とりあえずクライアントの台数が少ないので、ローカルにインストールして使うことで対処しました。